Thuốc và thực phẩm chức năng khác nhau về mục đích sử dụng, quy định pháp lý và tác dụng. Thuốc được dùng để điều trị, phòng ngừa bệnh và có tác dụng dược lý rõ ràng, được quản lý chặt chẽ bởi Bộ Y tế. Thực phẩm chức năng hỗ trợ sức khỏe, bổ sung dinh dưỡng, nhưng không phải là thuốc và không có tác dụng thay thế thuốc, được quản lý bởi Cục An toàn Thực phẩm.